Malkara, dünya üzerinde 40 54’ kuzey enlemi ile 26.52 doğu boylamları, arasında yer almaktadır. 1.225 km2 yüzölçümü ile Tekirdağ İlinin toprak alanı en geniş olan ilçesidir.

  Tekirdağ iline 56 km uzaklıkta olan Malkara’nın kuzey batısında, Edirne’nin Uzunköprü İlçesi, kuzey doğusunda Hayrabolu, güney doğusunda Şarköy, güneyinde Çanakkale’nin Gelibolu ilçesi, batısında ise Edirne’nin Keşan ilçesi bulunmaktadır.

  Malkara çevresinde bulunan İlçelerden Keşan’a 26 km., Uzunköprü’ye 72 km., Gelibolu’ya 100 km., Şarköy’e 48 km., Hayrabolu’ya 46 km., mesafededir. İlçede yüksek dağlar, vadiler yoktur.Genelde toprakları aşınmış tepelerden yarı ova özelliği gösteren plato görünümündedir.Tekirdağ İlimizin en önemli dağı olan Tekir Dağları Malkara’ya 25 km mesafededir.Bu dağlar İlçemizin güney bölümünde, Tekirdağ-Gelibolu istikametinde uzanırlar.İlçemiz Çimendere Köyü yakınında son bulur.Ganos dağı Tekir sıra dağlarının en önemli yükseltisidir.(845 m.). İlçenin sınırları içindeki en önemli yükseltiler ise; Elmalı-Karacahalil arasındaki Kuş Tüneyi (647m) tepesi, Panayır tepe (664m) Çimendere-Elmalı arasında Kartal tepe , yenidibek-Keşan arası İstikamlar tepe gösterilebilir.

  Malkara’nın yüzey şekilleri nedeni ile büyük akarsuları yoktur.Barajları ve göletleri besleyen dereler vardır. İlçede belli başlı ovalar ise; Evrenbey , Kırıkali, Hacısungur, Gözsüz, Karacahalil, Kalaycı, Sağlamtaş, İbribey ovalarıdır.Bunlar fazla geniş olmamakla birlikte bu ovalar ilçenin hudutları içinde doğal göl bulunmamaktadır.Yapay baraj ve göletler vardır. Karaidemir ve Kadıköy barajları en önemli yapay barajlardır.

  Bunun yanında, yine sulama amaçlı yapılan Yaylagöne, Vakıfidemir, Yenidibek(Pişman), Doluköy, Küçükhıdır, Karacagür göletleri yapılmıştır.Yapılan bu baraj ve göletlerle İlçenin sulanabilir arazi miktarı,28.360 dekara yükseltilmiştir.